MILAN – 2015/16 merupakan musim kelima Juan Jesus di Inter. Ia menyelesaikan dengan 23 penampilan di liga dan piala serta beberapa penampilan sempurna dalam sejumlah laga terbesar musim itu - derby pertama Serie A, kemenangan atas Napoli di Coppa Italia, dan leg kedua semifinal kontra Juventus.
Selepas bermain di posisi bek kiri dalam kemenangan atas AC Milan pada Oktober lalu, bintang asal Brasil itu tampil di tengah dalam barisan empat bek saat melibas Napoli 2-0. "Saya akan main dimanapun yang saya inginkan. Saya gembira dapat main di dua posisi," ucap Juan Jesus seusai pertandingan.
Duel melawan Napoli juga memperlihatkan Juan Jesus memakai ban kapten untuk kali kedua, sesudah yang pertama ketika bertemu Saint-Etienne di Europa League.
Dalam leg kedua semifinal Coppa Italia, dia kembali dipercaya menjadi kapten. Pada kesempatan itu, sebelum kick-off, ia melakukan gestur yang mengungkap sosoknya seperti apa.